Diseñada por el LIC. Julio Antonio Amorín Ponce (Historiador de la Ciénaga de Zapata), fue aprobada por La Asamblea Municipal del Poder Popular en sesión ordinaria, el 27 de Diciembre de 1997.
Se encuentra dividida en dos partes y su longitud siempre debe ser el doble del ancho:
- La superior, de color rojo: representando la sangre derramada por mártires y héroes, en las distintas épocas históricas y la causa que defendemos.
- La inferior, de color verde: representa nuestros bosques y entorno, donde se desarrollo el devenir histórico de este pueblo.
- Cocodrilo Cubano: simboliza la fauna, prehispanidad y al propio territorio cenaguero.
- Ramas de laurel: sinónimo de victorias.
- Borde azul: Simboliza el elemento natural que identifica al gran humedal (agua).
Observada y analizada como un todo, patentiza que la Ciénaga de Zapata es tierra de VICTORIAS.
